Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF804BA4D1E1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZNF804BA4D1E1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZNF804BA4D1E1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZNF804BA4D1E1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF804BA4D1E1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms