Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.79■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.79■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.58■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
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