Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN7Q9Y6W3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN7Q9Y6W3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms