Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP46A1Q9Y6A2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP46A1Q9Y6A2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CYP46A1Q9Y6A2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms