Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GTF3C3Q9Y5Q9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms