Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 EP400-208ENST00000611841 3129 ntTSL 512.61□□□□□ -0.391e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.645e-8■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.811e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.855e-8■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 SNORD3G-201ENST00000362796 215 ntBASIC9.55□□□□□ -0.881e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.881e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.011e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.031e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.538e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.438e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.288e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.278e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.248e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.938e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.898e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.868e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.838e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.688e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.668e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.598e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 BRD2-209ENST00000469132 1628 ntTSL 218.75■□□□□ 0.598e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.588e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-218ENST00000476727 1205 ntTSL 518.33■□□□□ 0.528e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TYK2-213ENST00000529739 842 ntTSL 218.14■□□□□ 0.498e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.478e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.428e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.428e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-222ENST00000636280 2462 ntTSL 517.53■□□□□ 0.48e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.398e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.378e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-204ENST00000441149 3286 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.338e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.238e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 NFE2-205ENST00000553198 1208 ntTSL 516.23■□□□□ 0.198e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.118e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.18e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.098e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.018e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-215ENST00000475471 836 ntTSL 214.93□□□□□ -0.028e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TCOF1-214ENST00000515035 5240 ntTSL 214.74□□□□□ -0.058e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TCOF1-213ENST00000514442 5195 ntTSL 214.46□□□□□ -0.098e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TYK2-221ENST00000592137 536 ntTSL 314.17□□□□□ -0.148e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.158e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.28e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.228e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TPX2-201ENST00000300403 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 BRD2-204ENST00000449025 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.288e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.288e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 213.3□□□□□ -0.288e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-227ENST00000637999 1429 ntTSL 513.1□□□□□ -0.318e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.338e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.348e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TLN1-202ENST00000378192 1693 ntTSL 212.86□□□□□ -0.358e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-201ENST00000277465 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.378e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.388e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TRIM27-205ENST00000481474 7006 ntTSL 1 (best)12.63□□□□□ -0.398e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-207ENST00000393608 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.48e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TYK2-215ENST00000530560 558 ntTSL 312.39□□□□□ -0.438e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TCOF1-203ENST00000394269 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.448e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-208ENST00000415526 2508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.7□□□□□ -0.548e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TCOF1-204ENST00000427724 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.62□□□□□ -0.558e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 511.58□□□□□ -0.568e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 BRD2-203ENST00000395287 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.728e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 DNM1-207ENST00000482638 672 ntTSL 510.15□□□□□ -0.788e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 CIZ1-216ENST00000476239 853 ntTSL 59.81□□□□□ -0.848e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 TYK2-208ENST00000527481 628 ntTSL 39.42□□□□□ -0.98e-6■■□□□ 13.6
UTP18Q9Y5J1 RPL3-207ENST00000459859 447 ntTSL 321.37■■□□□ 1.011e-9■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 RPL3-203ENST00000402527 1205 ntTSL 519.98■□□□□ 0.791e-9■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-9■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 RPL3-218ENST00000498462 669 ntTSL 319.27■□□□□ 0.681e-9■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 RPL3-208ENST00000460589 630 ntTSL 217.41■□□□□ 0.381e-9■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 RPL3-211ENST00000465618 2108 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.141e-9■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 RPL3-205ENST00000427905 782 ntTSL 514.88□□□□□ -0.031e-9■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 RPL3-206ENST00000453303 916 ntTSL 514.74□□□□□ -0.051e-9■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 RPL3-217ENST00000484615 827 ntTSL 213.81□□□□□ -0.21e-9■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 RPL3-209ENST00000461967 767 ntTSL 213.55□□□□□ -0.241e-9■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 RPL3-204ENST00000420536 711 ntTSL 59.69□□□□□ -0.861e-9■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-6■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 315.51■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.457e-10■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.397e-10■■□□□ 13.5
UTP18Q9Y5J1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-6■■□□□ 13.4
UTP18Q9Y5J1 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 518.88■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 13.4
UTP18Q9Y5J1 PDIA4-202ENST00000413966 550 ntTSL 218.87■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 13.4
UTP18Q9Y5J1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-6■■□□□ 13.4
UTP18Q9Y5J1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 13.4
UTP18Q9Y5J1 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 513.59□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 13.4
UTP18Q9Y5J1 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.42e-6■■□□□ 13.4
UTP18Q9Y5J1 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.622e-6■■□□□ 13.4
UTP18Q9Y5J1 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-7■■□□□ 13.3
UTP18Q9Y5J1 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.512e-7■■□□□ 13.3
UTP18Q9Y5J1 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.15□□□□□ -1.593e-22■■□□□ 13.3
UTP18Q9Y5J1 SNORD91B-201ENST00000391250 95 nt3.5□□□□□ -1.853e-22■■□□□ 13.3
UTP18Q9Y5J1 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.444e-10■■□□□ 13.3
UTP18Q9Y5J1 HSPA8-220ENST00000533238 465 ntTSL 36.83□□□□□ -1.322e-23■■□□□ 13.3
UTP18Q9Y5J1 FASN-211ENST00000637026 100 ntTSL 59.87□□□□□ -0.834e-9■■□□□ 13.1
UTP18Q9Y5J1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-8■■□□□ 13
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