RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553198.1

NFE2-205, Transcript of nuclear factor, erythroid 2, humanhuman

TSL 5

Gene NFE2, Length 1,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2-205ENST00000553198 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.6■■■■□ 3.77
NFE2-205ENST00000553198 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.59■■■■□ 3.13
NFE2-205ENST00000553198 ABCC9O60706 1549 aa34.46■■■■□ 3.11
NFE2-205ENST00000553198 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.83■■■□□ 2.85
NFE2-205ENST00000553198 NACADO15069 1562 aa32.63■■■□□ 2.81
NFE2-205ENST00000553198 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.4■■■□□ 2.78
NFE2-205ENST00000553198 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.23■■■□□ 2.75
NFE2-205ENST00000553198 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.23■■■□□ 2.75
NFE2-205ENST00000553198 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.17■■■□□ 2.74
NFE2-205ENST00000553198 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.08■■■□□ 2.73
NFE2-205ENST00000553198 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
NFE2-205ENST00000553198 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.95■■■□□ 2.71
NFE2-205ENST00000553198 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.88■■■□□ 2.69
NFE2-205ENST00000553198 SCRIBQ14160 1630 aa31.55■■■□□ 2.64
NFE2-205ENST00000553198 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.45■■■□□ 2.62
NFE2-205ENST00000553198 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.15■■■□□ 2.58
NFE2-205ENST00000553198 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
NFE2-205ENST00000553198 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.01■■■□□ 2.56
NFE2-205ENST00000553198 NCAPD3P42695 1498 aa30.13■■■□□ 2.41
NFE2-205ENST00000553198 SMARCA4P51532 1647 aa30.11■■■□□ 2.41
NFE2-205ENST00000553198 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.08■■■□□ 2.41
NFE2-205ENST00000553198 SMARCA2P51531 1590 aa29.97■■■□□ 2.39
NFE2-205ENST00000553198 HMGXB3Q12766 1538 aa29.95■■■□□ 2.38
NFE2-205ENST00000553198 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
NFE2-205ENST00000553198 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.81■■■□□ 2.36
NFE2-205ENST00000553198 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.77■■■□□ 2.36
NFE2-205ENST00000553198 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
NFE2-205ENST00000553198 ERCC6Q03468 1493 aa29.68■■■□□ 2.34
NFE2-205ENST00000553198 NESP48681 1621 aa29.68■■■□□ 2.34
NFE2-205ENST00000553198 CUX2O14529 1486 aa29.61■■■□□ 2.33
NFE2-205ENST00000553198 WIZO95785 1651 aa29.43■■■□□ 2.3
NFE2-205ENST00000553198 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.43■■■□□ 2.3
NFE2-205ENST00000553198 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.42■■■□□ 2.3
NFE2-205ENST00000553198 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
NFE2-205ENST00000553198 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.3■■■□□ 2.28
NFE2-205ENST00000553198 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.2■■■□□ 2.27
NFE2-205ENST00000553198 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.2■■■□□ 2.26
NFE2-205ENST00000553198 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
NFE2-205ENST00000553198 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NFE2-205ENST00000553198 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.01■■■□□ 2.23
NFE2-205ENST00000553198 WDR62O43379 1518 aa28.97■■■□□ 2.23
NFE2-205ENST00000553198 CFTRP13569 1480 aa28.93■■■□□ 2.22
NFE2-205ENST00000553198 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.91■■■□□ 2.22
NFE2-205ENST00000553198 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.9■■■□□ 2.22
NFE2-205ENST00000553198 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.7■■■□□ 2.18
NFE2-205ENST00000553198 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
NFE2-205ENST00000553198 PRDM2Q13029 1718 aa28.67■■■□□ 2.18
NFE2-205ENST00000553198 TOPBP1Q92547 1522 aa28.38■■■□□ 2.13
NFE2-205ENST00000553198 IFT140Q96RY7 1462 aa28.32■■■□□ 2.12
NFE2-205ENST00000553198 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
NFE2-205ENST00000553198 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.28■■■□□ 2.12
NFE2-205ENST00000553198 ABCC8Q09428 1581 aa28.24■■■□□ 2.11
NFE2-205ENST00000553198 OSCARQ8IYS5 282 aa28.21■■■□□ 2.11
NFE2-205ENST00000553198 TRIM41Q8WV44 630 aa28.18■■■□□ 2.1
NFE2-205ENST00000553198 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
NFE2-205ENST00000553198 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
NFE2-205ENST00000553198 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
NFE2-205ENST00000553198 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.089e-8■■■■■ 45.8
NFE2-205ENST00000553198 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.01■■■□□ 2.07
NFE2-205ENST00000553198 CUX1P39880 1505 aa27.97■■■□□ 2.07
NFE2-205ENST00000553198 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.95■■■□□ 2.07
NFE2-205ENST00000553198 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.95■■■□□ 2.06
NFE2-205ENST00000553198 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.95■■■□□ 2.06
NFE2-205ENST00000553198 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.95■■■□□ 2.06
NFE2-205ENST00000553198 CHD1O14646 1710 aa27.94■■■□□ 2.06
NFE2-205ENST00000553198 SOGA1O94964 1423 aa27.92■■■□□ 2.06
NFE2-205ENST00000553198 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
NFE2-205ENST00000553198 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
NFE2-205ENST00000553198 ARHGEF11O15085 1522 aa27.87■■■□□ 2.05
NFE2-205ENST00000553198 WDR97A6NE52 1622 aa27.81■■■□□ 2.04
NFE2-205ENST00000553198 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.77■■■□□ 2.04
NFE2-205ENST00000553198 FBLN2P98095 1184 aa27.74■■■□□ 2.03
NFE2-205ENST00000553198 GRIN2BQ13224 1484 aa27.68■■■□□ 2.02
NFE2-205ENST00000553198 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
NFE2-205ENST00000553198 PBRM1Q86U86 1689 aa27.64■■■□□ 2.02
NFE2-205ENST00000553198 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.63■■■□□ 2.01
NFE2-205ENST00000553198 ARAP1Q96P48 1450 aa27.63■■■□□ 2.01
NFE2-205ENST00000553198 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.62■■■□□ 2.01
NFE2-205ENST00000553198 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.61■■■□□ 2.01
NFE2-205ENST00000553198 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.6■■■□□ 2.01
NFE2-205ENST00000553198 SYNJ2O15056 1496 aa27.59■■■□□ 2.01
NFE2-205ENST00000553198 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.57■■■□□ 2
NFE2-205ENST00000553198 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
NFE2-205ENST00000553198 SYNJ1O43426 1573 aa27.56■■■□□ 2
NFE2-205ENST00000553198 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.54■■■□□ 2
NFE2-205ENST00000553198 TOP2BQ02880 1626 aa27.53■■■□□ 2
NFE2-205ENST00000553198 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
NFE2-205ENST00000553198 ADAMTS12P58397 1594 aa27.4■■□□□ 1.98
NFE2-205ENST00000553198 GRIN2AQ12879 1464 aa27.36■■□□□ 1.97
NFE2-205ENST00000553198 CEP170Q5SW79 1584 aa27.3■■□□□ 1.96
NFE2-205ENST00000553198 NUP160Q12769 1436 aa27.27■■□□□ 1.96
NFE2-205ENST00000553198 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.26■■□□□ 1.96
NFE2-205ENST00000553198 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.25■■□□□ 1.95
NFE2-205ENST00000553198 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.24■■□□□ 1.95
NFE2-205ENST00000553198 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
NFE2-205ENST00000553198 SHROOM2Q13796 1616 aa27.16■■□□□ 1.94
NFE2-205ENST00000553198 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.02■■□□□ 1.92
NFE2-205ENST00000553198 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
NFE2-205ENST00000553198 KIF27Q86VH2 1401 aa26.94■■□□□ 1.9
NFE2-205ENST00000553198 IGF1RP08069 1367 aa26.94■■□□□ 1.9
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