RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312156.8

NFE2-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2, Length 1,658 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2-201ENST00000312156 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.61■■■■□ 3.77
NFE2-201ENST00000312156 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.03■■■■□ 3.04
NFE2-201ENST00000312156 ABCC9O60706 1549 aa32.81■■■□□ 2.84
NFE2-201ENST00000312156 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
NFE2-201ENST00000312156 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.05■■■□□ 2.72
NFE2-201ENST00000312156 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.92■■■□□ 2.7
NFE2-201ENST00000312156 NACADO15069 1562 aa31.83■■■□□ 2.69
NFE2-201ENST00000312156 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.8■■■□□ 2.68
NFE2-201ENST00000312156 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.73■■■□□ 2.67
NFE2-201ENST00000312156 SCRIBQ14160 1630 aa31.19■■■□□ 2.58
NFE2-201ENST00000312156 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.13■■■□□ 2.57
NFE2-201ENST00000312156 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.97■■■□□ 2.55
NFE2-201ENST00000312156 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.83■■■□□ 2.53
NFE2-201ENST00000312156 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.78■■■□□ 2.52
NFE2-201ENST00000312156 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.08■■■□□ 2.41
NFE2-201ENST00000312156 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
NFE2-201ENST00000312156 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
NFE2-201ENST00000312156 SMARCA4P51532 1647 aa29.85■■■□□ 2.37
NFE2-201ENST00000312156 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.82■■■□□ 2.36
NFE2-201ENST00000312156 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.68■■■□□ 2.34
NFE2-201ENST00000312156 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
NFE2-201ENST00000312156 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.6■■■□□ 2.33
NFE2-201ENST00000312156 WIZO95785 1651 aa29.54■■■□□ 2.32
NFE2-201ENST00000312156 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.52■■■□□ 2.32
NFE2-201ENST00000312156 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.51■■■□□ 2.31
NFE2-201ENST00000312156 SMARCA2P51531 1590 aa29.47■■■□□ 2.31
NFE2-201ENST00000312156 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
NFE2-201ENST00000312156 NCAPD3P42695 1498 aa29.38■■■□□ 2.29
NFE2-201ENST00000312156 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
NFE2-201ENST00000312156 HMGXB3Q12766 1538 aa29.29■■■□□ 2.28
NFE2-201ENST00000312156 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
NFE2-201ENST00000312156 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.89■■■□□ 2.21
NFE2-201ENST00000312156 NESP48681 1621 aa28.59■■■□□ 2.17
NFE2-201ENST00000312156 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.57■■■□□ 2.16
NFE2-201ENST00000312156 CFTRP13569 1480 aa28.53■■■□□ 2.16
NFE2-201ENST00000312156 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.51■■■□□ 2.15
NFE2-201ENST00000312156 PRDM2Q13029 1718 aa28.38■■■□□ 2.13
NFE2-201ENST00000312156 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.27■■■□□ 2.12
NFE2-201ENST00000312156 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.26■■■□□ 2.11
NFE2-201ENST00000312156 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.26■■■□□ 2.11
NFE2-201ENST00000312156 ERCC6Q03468 1493 aa28.17■■■□□ 2.1
NFE2-201ENST00000312156 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.16■■■□□ 2.1
NFE2-201ENST00000312156 ABCC8Q09428 1581 aa28.07■■■□□ 2.08
NFE2-201ENST00000312156 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
NFE2-201ENST00000312156 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.99■■■□□ 2.07
NFE2-201ENST00000312156 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
NFE2-201ENST00000312156 CUX1P39880 1505 aa27.93■■■□□ 2.06
NFE2-201ENST00000312156 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
NFE2-201ENST00000312156 TOPBP1Q92547 1522 aa27.89■■■□□ 2.06
NFE2-201ENST00000312156 SYNJ1O43426 1573 aa27.89■■■□□ 2.06
NFE2-201ENST00000312156 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.89■■■□□ 2.06
NFE2-201ENST00000312156 WDR62O43379 1518 aa27.89■■■□□ 2.05
NFE2-201ENST00000312156 TOP2BQ02880 1626 aa27.81■■■□□ 2.04
NFE2-201ENST00000312156 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.81■■■□□ 2.04
NFE2-201ENST00000312156 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.78■■■□□ 2.04
NFE2-201ENST00000312156 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.73■■■□□ 2.03
NFE2-201ENST00000312156 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
NFE2-201ENST00000312156 TRIM41Q8WV44 630 aa27.68■■■□□ 2.02
NFE2-201ENST00000312156 CUX2O14529 1486 aa27.65■■■□□ 2.02
NFE2-201ENST00000312156 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.61■■■□□ 2.01
NFE2-201ENST00000312156 SOGA1O94964 1423 aa27.57■■■□□ 2
NFE2-201ENST00000312156 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
NFE2-201ENST00000312156 IFT140Q96RY7 1462 aa27.52■■■□□ 2
NFE2-201ENST00000312156 WDR97A6NE52 1622 aa27.48■■□□□ 1.99
NFE2-201ENST00000312156 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.45■■□□□ 1.99
NFE2-201ENST00000312156 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
NFE2-201ENST00000312156 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
NFE2-201ENST00000312156 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.979e-8■■■■■ 45.8
NFE2-201ENST00000312156 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
NFE2-201ENST00000312156 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.33■■□□□ 1.97
NFE2-201ENST00000312156 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.32■■□□□ 1.96
NFE2-201ENST00000312156 KIF27Q86VH2 1401 aa27.28■■□□□ 1.96
NFE2-201ENST00000312156 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.26■■□□□ 1.95
NFE2-201ENST00000312156 PBRM1Q86U86 1689 aa27.21■■□□□ 1.95
NFE2-201ENST00000312156 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
NFE2-201ENST00000312156 GRIN2BQ13224 1484 aa27.16■■□□□ 1.94
NFE2-201ENST00000312156 IGF1RP08069 1367 aa27.12■■□□□ 1.93
NFE2-201ENST00000312156 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.12■■□□□ 1.93
NFE2-201ENST00000312156 EEA1Q15075 1411 aa27.11■■□□□ 1.93
NFE2-201ENST00000312156 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.09■■□□□ 1.93
NFE2-201ENST00000312156 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.04■■□□□ 1.92
NFE2-201ENST00000312156 ADAMTS12P58397 1594 aa27.02■■□□□ 1.92
NFE2-201ENST00000312156 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
NFE2-201ENST00000312156 CUL7Q14999 1698 aa27■■□□□ 1.91
NFE2-201ENST00000312156 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.96■■□□□ 1.91
NFE2-201ENST00000312156 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.95■■□□□ 1.9
NFE2-201ENST00000312156 PRXQ9BXM0 1461 aa26.94■■□□□ 1.9
NFE2-201ENST00000312156 SYNJ2O15056 1496 aa26.92■■□□□ 1.9
NFE2-201ENST00000312156 CHD1O14646 1710 aa26.89■■□□□ 1.89
NFE2-201ENST00000312156 FBLN2P98095 1184 aa26.87■■□□□ 1.89
NFE2-201ENST00000312156 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.87■■□□□ 1.89
NFE2-201ENST00000312156 KIF21BO75037 1637 aa26.85■■□□□ 1.89
NFE2-201ENST00000312156 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
NFE2-201ENST00000312156 GRIN2AQ12879 1464 aa26.84■■□□□ 1.89
NFE2-201ENST00000312156 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.83■■□□□ 1.89
NFE2-201ENST00000312156 GOLGA3Q08378 1498 aa26.73■■□□□ 1.87
NFE2-201ENST00000312156 CEP170Q5SW79 1584 aa26.72■■□□□ 1.87
NFE2-201ENST00000312156 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.69■■□□□ 1.86
NFE2-201ENST00000312156 NUP160Q12769 1436 aa26.68■■□□□ 1.86
NFE2-201ENST00000312156 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.61■■□□□ 1.85
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