Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.23■■■■■ 6.91
NISCHQ9Y2I1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC58.23■■■■■ 6.91
NISCHQ9Y2I1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.22■■■■■ 6.91
NISCHQ9Y2I1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.21■■■■■ 6.91
NISCHQ9Y2I1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC58.21■■■■■ 6.91
NISCHQ9Y2I1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC58.19■■■■■ 6.91
NISCHQ9Y2I1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.18■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC58.18■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC58.17■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.17■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC58.17■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC58.17■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC58.17■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC58.17■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.16■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.16■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC58.16■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.15■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC58.15■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC58.15■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.14■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.14■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.13■■■■■ 6.9
NISCHQ9Y2I1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.12■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC58.11■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.11■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC58.11■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC58.1■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.1■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC58.09■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC58.09■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC58.08■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC58.08■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC58.08■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC58.07■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC58.07■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC58.07■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC58.06■■■■■ 6.89
NISCHQ9Y2I1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC58.06■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.06■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC58.04■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC58.04■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC58.04■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.04■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.03■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.02■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.01■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC58.01■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.01■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC58■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC58■■■■■ 6.88
NISCHQ9Y2I1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.99■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC57.99■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC57.98■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC57.97■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC57.97■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC57.97■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.97■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC57.97■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.96■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC57.96■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.96■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC57.96■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC57.95■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC57.95■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.95■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC57.94■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC57.94■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.94■■■■■ 6.87
NISCHQ9Y2I1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC57.93■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC57.93■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC57.93■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.93■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.92■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.92■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC57.92■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC57.92■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.91■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC57.9■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.89■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC57.89■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC57.89■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.89■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.89■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC57.89■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.88■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.88■■■■■ 6.86
NISCHQ9Y2I1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.86■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC57.86■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC57.85■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.85■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC57.85■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC57.84■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC57.84■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.83■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC57.82■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC57.82■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.82■■■■■ 6.85
NISCHQ9Y2I1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC57.82■■■■■ 6.85
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