Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM33Q9UPN9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM33Q9UPN9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms