Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCOLCE2Q9UKZ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCOLCE2Q9UKZ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCOLCE2Q9UKZ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms