Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERG28Q9UKR5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms