Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP3Q9UKI2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP3Q9UKI2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms