Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRRDQ9UH36 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRRDQ9UH36 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRRDQ9UH36 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRRDQ9UH36 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms