Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms