Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3BQ9UH17 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOBEC3BQ9UH17 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3BQ9UH17 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms