Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
RIMBP3Q9UFD9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
RIMBP3Q9UFD9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
RIMBP3Q9UFD9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
RIMBP3Q9UFD9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
RIMBP3Q9UFD9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
RIMBP3Q9UFD9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
RIMBP3Q9UFD9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
RIMBP3Q9UFD9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
RIMBP3Q9UFD9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
RIMBP3Q9UFD9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
RIMBP3Q9UFD9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RIMBP3Q9UFD9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
RIMBP3Q9UFD9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
RIMBP3Q9UFD9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RIMBP3Q9UFD9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms