Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHA6Q9UF33 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHA6Q9UF33 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms