Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SACSQ9NZJ4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SACSQ9NZJ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SACSQ9NZJ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms