Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00846Q9NV44 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00846Q9NV44 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms