Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA3Q9NST1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA3Q9NST1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA3Q9NST1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms