Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1RAPQ9NPH3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1RAPQ9NPH3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1RAPQ9NPH3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IL1RAPQ9NPH3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IL1RAPQ9NPH3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IL1RAPQ9NPH3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IL1RAPQ9NPH3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IL1RAPQ9NPH3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 608.4 ms