Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
HIPK3Q9H422 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIPK3Q9H422 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIPK3Q9H422 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms