Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EHD4Q9H223 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHD4Q9H223 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
EHD4Q9H223 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EHD4Q9H223 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms