Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFRA4Q9GZZ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GFRA4Q9GZZ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GFRA4Q9GZZ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms