Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REXO4Q9GZR2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REXO4Q9GZR2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REXO4Q9GZR2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms