Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM6SF1Q9BZW5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TM6SF1Q9BZW5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TM6SF1Q9BZW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TM6SF1Q9BZW5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM6SF1Q9BZW5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
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