Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF4Q9BSR8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YIPF4Q9BSR8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF4Q9BSR8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF4Q9BSR8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms