Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERP44Q9BS26 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERP44Q9BS26 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERP44Q9BS26 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERP44Q9BS26 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERP44Q9BS26 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERP44Q9BS26 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERP44Q9BS26 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERP44Q9BS26 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERP44Q9BS26 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERP44Q9BS26 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1937.2 ms