Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNS3Q9BQ31 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNS3Q9BQ31 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNS3Q9BQ31 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms