Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDF2Q99470 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDF2Q99470 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms