Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2CR12Q96Q35 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALS2CR12Q96Q35 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALS2CR12Q96Q35 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms