Protein–RNA interactions for Protein: Q96PG1

MS4A4E, Putative membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4E, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4EQ96PG1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MS4A4EQ96PG1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4EQ96PG1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4EQ96PG1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms