Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00052Q96N35 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00052Q96N35 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms