Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01600Q96MT4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01600Q96MT4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms