Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP6Q96FZ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP6Q96FZ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP6Q96FZ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP6Q96FZ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms