Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF31Q96EP0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF31Q96EP0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF31Q96EP0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms