Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NMD3Q96D46 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NMD3Q96D46 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMD3Q96D46 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms