Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GCC1Q96CN9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCC1Q96CN9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GCC1Q96CN9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms