Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM3DQ96BQ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3DQ96BQ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM3DQ96BQ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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