Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
LRRC59Q96AG4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC59Q96AG4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LRRC59Q96AG4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRRC59Q96AG4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms