Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC47Q96A33 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC47Q96A33 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
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