Protein–RNA interactions for Protein: Q969M3

YIPF5, Protein YIPF5, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF5Q969M3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YIPF5Q969M3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF5Q969M3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF5Q969M3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.7 ms