Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC9Q92623 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC9Q92623 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC9Q92623 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms