Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX38Q92620 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX38Q92620 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms