Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CNKSR2Q8WXI2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CNKSR2Q8WXI2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNKSR2Q8WXI2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNKSR2Q8WXI2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms