Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SELENOMQ8WWX9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SELENOMQ8WWX9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SELENOMQ8WWX9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SELENOMQ8WWX9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SELENOMQ8WWX9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms