Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV28

BLNK, B-cell linker protein, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLNKQ8WV28 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BLNKQ8WV28 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BLNKQ8WV28 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BLNKQ8WV28 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms