Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV28

BLNK, B-cell linker protein, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLNKQ8WV28 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BLNKQ8WV28 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BLNKQ8WV28 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BLNKQ8WV28 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
BLNKQ8WV28 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BLNKQ8WV28 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BLNKQ8WV28 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms