Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEK9Q8TD19 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK9Q8TD19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK9Q8TD19 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK9Q8TD19 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms