Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C17orf47Q8NEP4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C17orf47Q8NEP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms