Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC112Q8NEF3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC112Q8NEF3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC112Q8NEF3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC112Q8NEF3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms